בזיליקה מהמאה ה-16 בה ממוקמת כנסייה קטנה – כנסיית פורציונקולה (Porziuncola). זהו המקום בו נוסד מסדר הפרנציסקנים והמקום בו קידש פרנציסקוס הקדוש את קלרה הקדושה כ"כלת ישו".
פרנציסקוס מת בכוך סמוך ב-3 באוקטובר 1226.
בנוסף לציורי הקיר היפים שהוקדשו לפרנציסקנים ופוליפטיך יפהפה של אנדראה דלה רוביה, יש פה את שיח הוורדים (בגינה הקטנה שבחצר הפנימית) שהמסורת מספרת שפרנציסקוס זרק עצמו לתוכ כדי להימנע מפיתוי, את המערה שבה התפלל ופסל שלו, שהיונים אוהבות.
אל הבזיליקה מגיעים מבקרים מאמינים רבים והיא נחשבת למרכז רוחני של הפרנציסקנים.