כמו הבזיליקה, בית הטבילה המתומן הוקם על ידי קונסטנטינוס במאה הרביעית. כיום הוא משמש לטקסים בשבת קודש.
במאה החמישית הוא נבנה מחדש על ידי סיקסטוס השלישי שהקים את שמונת עמודי הבהט במרכז ורשם את המילים המתייחסות לטבילה על האנטבלטורה המתומנת.
העמודים העליונים ופתח האור מתוארכים למאה ה-16. קפלות נוספו לבית הטבילה על ידי אפיפיורים שונים במהלך השנים, ואורבן השמיני העניק למבנה את מראהו הנוכחי בשנות ה-17 לספירה; ציורי הקיר מתוארכים לתקופה זו.
שימו לב לאפסיס בקפלה די סנטה רופינה המקושט בפסיפס יפהפה מהמאה החמישית.
בולטת במיוחד היא קפלת סן ונאנציו (San Venanzio) עם תקרת עץ מהמאה ה-16 ופסיפסים מוזהבים מהמאה השביעית המעידים על השפעתה החזקה של הכנסייה המזרחית באותם ימים. במרכז התקרה אליפסה המתארת את עליית הבתולה עם כוכבים. הטימפנון וקברי הקרדינלים הם מאת קרלו ריינאלדי. הפסלים הם מאת Jacopo Antonio Fancelli, תלמיד ועוזרו של ברניני, והדיוקן והפוטי מאת פאולו נלדיני.